Эффективность и результативность деятельности любого учреждения, в том числе Управления Федерального казначейства по Республики Тыва, зависит от многих факторов. Одним из основных элементов в этом деле является внутренний контроль, который представляет собой непрерывный процесс, направленный на обеспечение соблюдения требований нормативных правовых актов Российской Федерации и регламентов, повышение эффективности и результативности осуществляемых операций. Внутренний контроль как элемент управления является весьма важной ее частью и включает в себя не только специфические аспекты управления, но и всю управленческую деятельность, в том числе организационную и административную. В органах Федерального казначейства методами осуществления внутреннего контроля являются самоконтроль, контроль по уровню подчиненности, а также проведение контрольно-аудиторскими подразделениями проверок тематического и комплексного характера.